Фамилия Могинова — женская форма, а мужская, Могинов, образована по самой частотной русской модели: от прозвища или имени, оканчивающегося на согласный, добавляли суффикс -ов. Вопрос в том, что легло в основу — слово «могила» или что-то другое.

Самая прямая и правдоподобная версия — прозвище Могила. В старину так могли назвать человека угрюмого, молчаливого, «тёмного», либо того, кто жил близ кладбища или работал могильщиком. Фамилии от «могилы» встречаются в разных славянских языках: у украинцев известен гетман Пётр Могила, у русских — Могилевские, Могильниковы. Могинов здесь — вариант, где прозвище Могила перешло в фамилию через отчество: «чей? — Могилов сын», а со временем закрепилось как Могинов. Суффикс -ин, который мог бы указывать на принадлежность матери (например, Могина — мать), здесь не сработал: основа Могин- не зафиксирована как самостоятельное имя или прозвище, так что -ов первичен.

Есть и более редкая версия — от тюркского имени или прозвища. В татарском и башкирском языках есть слово «мөгыйн» (помощь, помощник), которое в русской записи могло превратиться в Могин, а затем в Могинов. Но эта гипотеза слабее: фамилия почти не встречается в Поволжье и на Урале, где такие заимствования обычны. Основной ареал Могиновых — центральные и южные области России, что говорит скорее в пользу славянского корня.

Географически фамилия редкая. В дореволюционных списках она изредка попадается среди крестьян и мещан Воронежской, Тамбовской, Курской губерний. Дворянских родов с такой фамилией нет — это стопроцентно крестьянская или посадская фамилия, возникшая не в высших слоях, а в среде, где прозвища были прямыми и бытовыми.

В написании возможна путаница с фамилией Магинов (от имени Маг, Магий) или Могилёв, но Могинова — самостоятельная форма, и её носителям стоит искать корни именно в прозвище Могила, а не в географическом названии.