Фамилия Моисее — редкий пример фамилии, которая не вписывается в привычную схему «основа + суффикс». В ней нет ни -ов, ни -ин, ни -ский. Она застыла в форме, которая напоминает родительный или предложный падеж древнерусского имени. Перед нами не отчество, а, скорее всего, прозвище или указание на принадлежность, закрепившееся в виде фамилии без дополнительного оформления.

Основа фамилии — каноническое имя Моисей. В русской традиции это имя всегда было связано с библейским пророком, но в быту его давали не так часто, как, например, Ивана или Петра. Чаще всего его носили крещёные евреи или представители духовенства, а в крестьянской среде — изредка, как память о предке. Фамилия Моисее могла возникнуть в среде, где фамилии ещё не устоялись, и человека записывали «Моисее» — то есть «из рода Моисея» или «сын Моисея», но без суффикса, что характерно для ранних, «полуфамильных» форм на Русском Севере или в некоторых областях Украины и Беларуси.

Суффикс -ее в данной фамилии — не типичный русский фамильный суффикс. В русском языке нормативным было бы Моисеев (от Моисей + -ев). Форма Моисее могла возникнуть под влиянием украинской или белорусской традиции, где фамилии нередко оканчиваются на -ей или -е (Моисеей, Моисее), или как результат усечения: от более полной формы Моисеенко, Моисеевич отбросили вторую часть. В некоторых говорах так называли человека, который «моисеит» — то есть ведёт себя как библейский пророк: строгий, требовательный, возможно, даже занудный. Но эта версия менее вероятна: имя-основа здесь явно первична.

Географически фамилия Моисее встречается крайне редко. Основные очаги — западные регионы России (Брянская, Смоленская области) и восток Украины. Встречается она и у староверов, которые любили ветхозаветные имена и сохраняли архаичные формы словообразования. В дореволюционных переписях такую фамилию могли записать как Моисеев, а позже, при унификации, часть носителей вернулась к исходному написанию.

С точки зрения социальной истории, носители фамилии Моисее вряд ли принадлежали к знати. Скорее всего, это были крестьяне или мещане, а если имя давалось в духовной среде — то причетники или низшие церковнослужители. Фамилия не получила широкого распространения, поэтому сегодня её можно считать редкой и локальной. Если вы носите фамилию Моисее, ваши предки, вероятно, жили в относительно замкнутой общине, где сохранялись старые речевые привычки.