Фамилия Моханько звучит на украинский лад, и это первое, что бросается в глаза. Суффикс -ко — один из самых распространённых в украинской ономастике, он указывает на происхождение с территории современной Украины или юга России. По модели образования фамилия похожа на тысячи других: Довганько, Петренко, Шевченко. Но её основа — Мохань — встречается реже, что и делает фамилию интересной для разбора.

Скорее всего, в основе лежит прозвище Мохань. В украинских и южнорусских говорах слово «мох» и его производные часто давали людям с мягкими, пушистыми волосами или бородой, похожими на мох. Не исключено, что прозвище закрепилось за человеком невысокого роста, коренастым, «мохнатым» — в переносном смысле. В. И. Даль фиксирует слово «мохнач» как «косматый, лохматый человек», а «мохань» могло быть его уменьшительно-ласкательной формой. Прямых параллелей с известными историческими фамилиями вроде Мохов или Мохнаткин здесь нет — Моханько стоит особняком, что говорит о локальном, возможно, диалектном происхождении.

Вторая версия, менее вероятная, но допустимая: связь с тюркским именем или прозвищем. В языках тюркской группы есть корень «мох» или «мохан», означающий «сильный», «могучий». Однако суффикс -ко — чисто славянский, и если бы основа была заимствована, фамилия всё равно оформилась бы уже на славянской почве. Правдоподобнее всё же первая версия — от внешности или характера.

Географически фамилия тяготеет к центральным и западным областям Украины. Встречается в Черкасской, Винницкой, Хмельницкой областях, реже — в Беларуси и Польше (в пограничных районах). В России носители Моханько — это, как правило, потомки переселенцев с Украины времён Столыпинской аграрной реформы или более поздних миграций. Сословно фамилия не аристократическая: суффикс -ко в малороссийской среде чаще всего получали крестьяне и казаки, реже — мещане. Дворянских родов с такой фамилией в «Бархатной книге» или «Общем гербовнике» нет.

Если сравнивать с однокоренными, то Моханько стоит в одном ряду с Мохнач, Мохнаткин, Моховиков, но отличается именно уменьшительным оттенком. «Мохань» — это не просто «мохнатый», а скорее «мохнатенький», что могло быть и ласковым прозвищем в семье, и ироничным — в среде сверстников. Со временем прозвище перешло в фамилию, закрепившись за потомками того самого человека с характерной внешностью.