Фамилия Мохарева — женская форма, мужская — Мохарев. В основе лежит прозвище или мирское имя Мохарь. Слово «мохарь» в русских говорах имело несколько значений, и фамилия могла возникнуть в разных местах независимо. Самый вероятный источник — диалектное «мохарь» в значении «мотыга, тяпка» или, шире, «инструмент для рыхления земли». Тогда Мохарем называли земледельца, крестьянина, работающего вручную — прозвище по орудию труда, как Косарев или Топоров.

Есть и другая, более редкая версия: в некоторых южнорусских и украинских говорах «мохарь» означало «пучок, кисть, бахрома» (ср. «мохры»). В этом случае прозвище могло относиться к одежде — например, к человеку, носившему одежду с кистями, или к тому, кто их изготавливал. Третья возможность — связь с тюркским «мохар» (вид шелковой ткани), но это предположение слабее: фамилия не характерна для регионов с сильным татарским влиянием.

Фамилия образована по типичной восточнославянской модели: основа на мягкий согласный (-арь) дала суффикс -ев, а не -ов. Это грамматическая особенность, отличающая Мохарева от, скажем, Мохарова (если бы такая фамилия существовала). Подобный суффикс встречается у фамилий от прозвищ на -арь: Писарев, Токарев, Звонарёв. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Моха́рев.

Фамилия редкая, встречается в основном в центральных областях России — Воронежской, Тамбовской, Липецкой. В дореволюционных источниках Мохаревы фиксируются как крестьяне и мещане. Никакого дворянского корня у этой фамилии нет, и известных исторических деятелей с ней не отмечено — перед нами чисто народное прозвище, закрепившееся за родом работящих людей.