Фамилия Мохначева (и её вариант Мохначёва) отсылает к прозвищу Мохнач. В словаре В. И. Даля зафиксировано слово «мохна» — пучок шерсти или перьев у животных и птиц. Отсюда и прозвище: так в шутку называли человека неопрятного, взъерошенного, с густыми волосами, который выглядел лохмато. Смысл прозвища был не столько обидным, сколько бытовым — метко подмеченная внешность.

Интересно, что прозвище Мохнач могло выполнять и роль оберега. В народной традиции нередко давали «некрасивые» имена, чтобы уберечь ребёнка от сглаза или злых сил: называли лохматым, а человек вырастал опрятным и удачливым. Так что за фамилией может стоять не насмешка, а пожелание благополучия на будущее.

В письменных источниках фамилия встречается уже в конце XV века. В «Ономастиконе» С. Б. Веселовского упомянут Мохначёв Андрей, крестьянин, 1495 год, Новгород. Это одно из ранних документальных свидетельств бытования фамилии в северных русских землях.

Словообразовательная модель простая: к основе «мохнач» добавили типичный русский суффикс принадлежности -ев, а затем родовое окончание -а. По такой же схеме возникли многие фамилии от прозвищ — например, Бородачёв или Усачёв. Написание через «ё» (Мохначёв) и через «е» (Мохначев) — это орфографические варианты одной фамилии, которые разошлись в документах: в советское время букву «ё» часто заменяли на «е» при оформлении паспортов и метрик.

Родственные фамилии — Мохнатов, Мохнаткин, Мохнач — все они выросли из одного корня «мох», который указывает на мохнатость, пушистость, а в переносном смысле — на небрежный внешний вид. Так что предки носителей фамилии Мохначева, скорее всего, были людьми с заметной шевелюрой или просто носили шутливое прозвище, закрепившееся за родом на века.