Фамилия Мокрынина — женская форма, а её мужской вариант — Мокрынин. Она образована по самой распространённой в русском языке модели: к основе прозвища или имени добавлялся суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — Мокрынин, то есть сын или потомок Мокрыни). В этом суффиксе кроется ключевая подсказка: фамилия не могла возникнуть от слова, оканчивающегося на твёрдый согласный или -а/-я, иначе появился бы суффикс -ов. Значит, основа — «Мокрыня».

Что такое «Мокрыня»? Это древнерусское прозвище, напрямую связанное с прилагательным «мокрый». В говорах «мокрыня» означало сырость, слякоть, дождливую погоду. Но человека так могли прозвать не за погоду, а за характер или внешность. В ономастике известен принцип: прозвище часто давали по контрасту или по заметной детали. «Мокрыня» — скорее всего, человек, который часто мок под дождём (рыбак, перевозчик, бурлак), либо тот, кто отличался плаксивостью, «мокрыми глазами». В крестьянской среде такие прозвища были обычны и не несли оскорбления — они фиксировали яркую черту.

Менее вероятная, но возможная версия: связь с каноническим именем Мокий (от греческого «насмешник»). В народной речи имя Мокий могло превратиться в Мокря, Мокрыня через уменьшительно-ласкательные формы. Однако для фамилии Мокрынин такое происхождение спорно: суффикс -ыня характернее для прозвищной, а не крестильной основы.

Географически фамилия редкая. Основные очаги бытования — северные и центральные области России: Архангельская, Вологодская, Костромская области. Там, в зоне избыточного увлажнения, прозвище Мокрыня могло быть особенно уместным. В дореволюционных переписях встречаются единичные случаи, в основном среди крестьян и мещан. Дворянских родов с такой фамилией нет.

По структуре фамилия прозрачна: корень «мокр-», суффикс «-ын-» и окончание «-ин». Сравните с однокоренными: Мокров, Мокрецов, Мокроусов. Мокрынин стоит особняком — суффикс -ыня придаёт основе оттенок древности и диалектности. Это не фамилия, придуманная в семинарии или канцелярии, а народное образование, сохранившее живую речь предков.