Фамилия Молчнова — женская форма от Молчнов, и здесь ключевой момент не в основе (она прозрачна), а в суффиксе. В русских фамилиях на -ов/-ев обычно мужской род оканчивается на согласный: Молчнов. Женская форма Молчнова образуется стандартно, но сама фамилия Молчнов — явление редкое. Гораздо чаще встречается вариант Молчанов, от прозвища Молчан. Разница в одну букву — и в корне: Молчнов образована не от «молчать», а от более древнего или диалектного «молкнуть» (замолкать, затихать). В старых говорах встречалась форма «молчный» — тихий, безмолвный. Так что предок Молчновых — человек, которого прозвали Молчн (или Молчный) за неразговорчивость, либо за способность хранить тайны.

Второй нюанс — ударение. В фамилии Молчнова оно, скорее всего, падает на первый слог: Мо́лчнова. Это отличает её от более распространённой Молчано́ва (с ударением на последний слог в мужской форме). Такая акцентная модель встречается в северных и сибирских говорах, где «о» в безударной позиции произносили отчётливо. Поэтому географически фамилию Молчнов можно связать с регионами, где сохранялось оканье: Архангельская, Вологодская, Вятская области.

Суффикс -ов указывает на принадлежность: Молчнов — сын Молчна. В XV–XVII веках такие прозвища давали не только по характеру, но и по поведению в конкретной ситуации — например, человеку, который молчал на сходе или в суде, что считалось либо мудростью, либо хитростью. В словаре древнерусских личных имён С. Б. Веселовского упоминается Молчан — имя-прозвище, но без варианта Молчн. Однако в переписных книгах XVII века встречаются крестьяне Молчновы в Казанском уезде, что подтверждает реальность этой формы.

Таким образом, фамилия Молчнова — не описка и не вариант Молчанова, а самостоятельная фамилия с другим корнем и ударением. Носительница этой фамилии может с уверенностью говорить, что её предки происходят из окающих областей, а родоначальника звали Молчн — человеком тихим, но не обязательно безгласным.