Молдованюк — фамилия, которая сразу указывает на географическое происхождение её носителей. В её основе лежит название исторической области Молдова, а точнее — Молдавского княжества. Суффикс -юк характерен для украинской, реже белорусской ономастики: в украинском языке он выполняет ту же функцию, что русский -ов или -ин, то есть обозначает принадлежность или родство. Молдованюк буквально означает «потомок молдаванина» или «человек из Молдовы».

Фамилия образована по продуктивной модели: к корню Молдов- присоединён типичный для западных и центральных регионов Украины суффикс -ан- (как в фамилиях Вовкан, Стецан), а затем — патронимический -юк. Получается трёхчленная конструкция: Молдов- + -ан- + -юк. Первая ступень (Молдован) — это прозвище или этноним, обозначавшее выходца из Молдавии. Вторая ступень (-юк) превращает это прозвище в фамилию, передающуюся по наследству.

Встречается фамилия преимущественно на западе Украины: в Черновицкой, Ивано-Франковской, Тернопольской областях, а также среди украинской диаспоры в Молдове и Румынии. Исторически такие фамилии давали переселенцам: молдаване, оседавшие на украинских землях, получали прозвище Молдован, а их дети уже становились Молдованюками. Важно не путать с фамилией Молдованов — это русская форма с суффиксом -ов, распространённая в России и на востоке Украины.

В отличие от многих фамилий, где этимология спорна, здесь всё прозрачно: этноним «молдаванин» в основе не вызывает сомнений. Единственный нюанс — могло ли прозвище относиться к человеку, не имевшему молдавских корней, а просто торговавшему с Молдавией или носившему молдавскую одежду. Такое тоже бывало, но в случае с Молдованюком, учитывая ареал бытования, первая версия (прямое указание на происхождение) выглядит убедительнее.