Фамилия Молдованов образована от прозвища Молдован, восходящего к аналогичному этнониму. Молдоване – народ, живущий не только в Молдавии, но и на территории Украины, России, Казахстана и других стран. Таким образом, прозвище могло указывать на национальную принадлежность основателя рода. Однако не исключено, что Молдованом могли прозвать и русского, перенявшего обычаи и привычки этого народа. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Молдован, со временем получил фамилию Молдованов.