Фамилия Молькин — редкий пример того, как за привычным русским окончанием скрывается имя, уходящее корнями в античность. Вопреки ожиданию, основа здесь не связана с молью или чем-то мелким и бытовым. Скорее всего, фамилию образовали от краткой формы Молька, которая, в свою очередь, произошла от церковного имени Молий. Это имя встречается в святцах: его носил мученик Молий, день памяти которого приходится на 2 сентября (20 августа по старому стилю). Значит, предок носителя фамилии был крещён этим редким именем, а в быту его звали уменьшительно Молька, и уже от этого прозвища по обычной русской модели с суффиксом -ин возникла фамилия: Молька → Молькин.

Точное значение имени Молий остаётся предметом догадок. Наиболее правдоподобная версия связывает его с латинскими словами moles — «масса, глыба, скала» или molio — «строить, воздвигать». Оба значения согласуются с образом крепкого, основательного человека, хотя для повседневного употребления это не имело значения: имя воспринималось просто как личное, без оглядки на этимологию. Альтернативные объяснения, например, от греческого «моль» или от диалектных слов, выглядят натянуто и не подтверждаются источниками.

Стоит обратить внимание на суффикс -кин. В русской ономастике он указывает на принадлежность: Молькин буквально значит «сын Мольки». Такая модель активно работала в северных и центральных русских говорах, где краткие формы имён были особенно распространены. Если бы фамилия возникла на юге или в дворянской среде, мы бы скорее увидели вариант Мольков, но форма с -ин закрепляет за фамилией крестьянское или посадское происхождение.

Само имя Молий настолько редко, что фамилия Молькин почти наверняка имеет единый очаг возникновения. Семьи с такой фамилией встречаются точечно, без массового расселения, что типично для фамилий, образованных от нечастых календарных имён. В архивных документах XVII–XVIII веков подобные фамилии фиксировались в переписных книгах, но массового распространения не получили — носителей всегда было немного, и родство между разными ветвями Молькиных, вероятно, восходит к одному общему предку.

Если коротко: Молькин — это не прозвище по профессии или внешности, а память о крестильном имени, которое сегодня почти забыто. Фамилия сохранила для нас ту форму, в которой редкое церковное имя Молий звучало в народной среде — просто и по-домашнему: Молька.