Фамилия Момунова — женская форма фамилии Момунов. Её основа, Момун, почти наверняка восходит к тюркскому или монгольскому личному имени. В ряде тюркских языков слово «момун» означает «смирный», «кроткий», «послушный». Так могли назвать ребёнка с пожеланием спокойного нрава, либо это было прозвище взрослого человека, закреплённое за ним в быту.

Образование фамилии прозрачно: к основе Момун добавили русский патронимический суффикс -ов (в женском варианте -ова), что типично для фамилий народов, вошедших в состав Российской империи. В среде казахов, киргизов, татар или башкир имя Момун встречается нередко, поэтому географический ареал фамилии Момунова — преимущественно Средняя Азия, Поволжье и Южный Урал. Встречается и у народов Северного Кавказа, где тюркские имена также были распространены.

Интересная деталь: в некоторых тюркских языках «момун» — не столько имя, сколько обозначение должности или статуса. В Кокандском ханстве и соседних государствах момун — это сборщик налогов или управляющий у мелкого владетеля. Если предок носителя фамилии занимал такую должность, прозвище могло закрепиться за его потомками, перейдя в фамилию. Правда, эта версия менее вероятна, чем происхождение от личного имени: прозвища по должности обычно оформлялись иначе.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Момин, Момынов, Момунджанов — показывает, что основа Момун дала несколько вариантов написания и оформления, в зависимости от местных диалектов и традиций записи в метриках. Фамилия Момунова — один из самых прямых и неискажённых вариантов.