Фамилия Моргалина — одна из тех, где на первый взгляд очевидная основа таит в себе лингвистическую загадку. Проще всего было бы связать её с глаголом «моргать», но в русских фамилиях на -ин такую основу почти не встретишь: прилагательное «моргалый» неупотребительно, а прозвище Моргала, от которого могла бы пойти фамилия, в исторических документах не фиксируется. Вместо этого стоит присмотреться к другому глаголу — «моргать» в значении «мигать, мерцать», но с тюркским следом. В южнорусских и украинских говорах «моргаль» — это не только тот, кто часто моргает, но и прозвище хитрого, увёртливого человека, который «моргает глазом», подавая знак. Именно эта модель — прозвище Моргаль плюс суффикс принадлежности -ин — даёт фамилию Моргалин, а женская форма Моргалина закрепилась через родственную связь: «жена Моргалина» или «дочь Моргалина».

Словообразовательная конструкция здесь простая: основа «моргал-» (от «моргать») плюс суффикс -ин, указывающий на принадлежность к роду. В отличие от фамилий на -ов (сын Моргала — Моргалов), вариант на -ин типичен для прозвищ, оканчивающихся на -а/-я, что подтверждает личное, а не отцовское происхождение. Вероятнее всего, первый носитель получил уличное прозвище Моргала за манеру щуриться, часто моргать или за привычку тайно перемигиваться — в крестьянской среде такие приметные черты быстро становились родовым именем.

Географически фамилия Моргалина редкая, встречается в основном в центральных и южных областях России, а также на Украине, где суффикс -ин в женском роде не переоформляли в -ина, а оставляли как есть — это норма для украинской ономастики. В отличие от более частых Моргалевых или Моргачёвых, форма на -ина сохранила архаичное окончание, которое в русском языке постепенно вытеснялось фамилиями на -ов. Поэтому Моргалина — не просто вариант, а реликтовая форма, указывающая на старую традицию именования по прозвищу, а не по отчеству.

Если отбросить маловероятную версию о связи с латинским «margo» (край) или греческим «морга» (удел), остаётся один надёжный корень — «моргать». Фамилия не аристократическая, не дворянская, а народная, крестьянская или мещанская. Её носительницы могли происходить из семей, где дед или прадед был известен как Моргала — человек с острым, «моргающим» взглядом или хитрец, умевший подать знак глазами.