Фамилия Моргуновский восходит к прозвищу Моргун, связанному с глаголом «моргать». Это прозвище имело то же значение, что и диалектные Мельгун, Мигач, Мигун — «тот, кто часто мигает, моргает», «кто подмигивает, перемигивается с кем-либо», «волокита, шалун», а также «зевака, лентяй». Таким образом, фамилия Моргуновский может указывать как на физические особенности, так и на характер предка. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Моргун, со временем получил фамилию Моргуновский.