Фамилия Морщагин образована от личного прозвища Морщага — так в старину могли назвать человека, чья внешность или занятие были связаны со словом «морщина», то есть «складочка, сборка, сгиб ткани или кожи». В основе фамилии лежит не имя и не ремесло в чистом виде, а меткое бытовое прозвище, каких в русских деревнях давали множество.

Словообразовательная модель здесь проста и прозрачна: к прозвищу Морщага добавили типичный русский патронимический суффикс -ин, который указывал на принадлежность потомку. Морщагин буквально означает «сын Морщаги», «из рода Морщагиных». Такой тип фамилий — на -ин — характерен для северных и северо-восточных регионов России, где он встречался чаще, чем на юге и западе, где преобладали формы на -ов/-ев.

Само прозвище Морщага неоднозначно, и здесь стоит разобраться подробнее. Первая версия, самая прямая, отсылает к внешности: морщинистый человек, старик с изрытым лицом. Но есть и более интересное предположение, связанное с ремеслом. В говорах слово «морщить» означало «собирать в складки», «делать сборки», и это действие было ключевым в портняжном деле, особенно при пошиве головных уборов. Мастер, который закладывал складки и сборки на ткани, вполне мог получить прозвище Морщага — по роду занятий, а не по лицу. Эта версия правдоподобнее: прозвища по профессии в крестьянской среде были распространены шире, чем прозвища по случайным чертам внешности, хотя полностью исключать первую возможность нельзя.

Со временем прозвище закрепилось за потомками, и уже в документах XVII–XVIII веков можно встретить крестьян и посадских людей с фамилией Морщагины. Сословного барьера фамилия не имела: её носили и крестьяне, и мещане, и служилые люди, что типично для фамилий, образованных от прозвищ, а не от канонических имён.

Отдельного внимания заслуживает редкость фамилии. Морщагины не принадлежат к числу массовых русских фамилий, и это делает её ценной для генеалогического поиска: найти своих предков по такой фамилии проще, чем по распространённым Ивановым или Кузнецовым. Встречается она преимущественно в центральных и северных губерниях России, что согласуется с типом словообразования на -ин.