Фамилия Морщагин образована от личного прозвища Морщага и принадлежит к распространённому типу русских фамилий, построенных по модели «прозвище + суффикс -ин». Этот суффикс указывал на принадлежность: Морщагин буквально значит «сын Морщаги» или «человек из семьи Морщаги». Такая модель была особенно типична для северных и центральных русских земель, где фамилии на -ин встречались чаще, чем на юге.

Само прозвище Морщага восходит к слову «морщина» — «складочка, сборка, сгиб ткани, кожи». Но здесь есть развилка в толковании. Первая версия, самая простая: прозвище дали человеку с морщинистым лицом, что не редкость для деревенских прозвищ, которые часто подмечали внешность. Вторая версия связана с ремеслом: Морщагой могли назвать портного или скорняка, который работал со сборками и складками ткани, то есть «морщил» материал при пошиве. В этом случае прозвище переходило в разряд профессиональных, как, например, у фамилий Швецов или Скорняков. Правдоподобнее выглядит вторая трактовка — она объясняет, почему прозвище закрепилось за родом и дало устойчивую фамилию, а не угасло вместе с внешностью первого носителя.

Если опираться на словообразовательный анализ, фамилия Морщагин стоит в одном ряду с такими однокоренными фамилиями, как Морщин, Морщаков, Морщаковский. Все они отталкиваются от одного корня, но расходятся в суффиксах, что отражает разные диалектные и временные пласты. Морщагин — форма с уменьшительно-личным суффиксом -аг-, который придавал прозвищу оттенок фамильярности или иронии. Такие суффиксы часто встречались в северных говорах, что может указывать на возможное происхождение рода из Поморья или Вологодчины, хотя точное место и время возникновения фамилии сейчас установить сложно — процесс формирования фамилий в разных регионах растянулся на столетия.

Стоит добавить, что в старых документах фамилия могла писаться через «а» — Морщагинъ, с твёрдым знаком на конце, что типично для дореволюционной орфографии. Вариативность написания встречалась и в XIX веке: иногда путали с фамилией Морщаков, но это разные роды, и смешивать их не стоит.

Несмотря на то что фамилия не относится к числу громких дворянских родов и не встречается в боярских списках, она сохранила в себе живую память о прозвище, которое могло родиться в ремесленной или крестьянской среде. Морщагины — это пример того, как обычное слово, связанное с трудом или внешностью, превратилось в устойчивый родовой знак. Фамилия представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры, поскольку через неё мы видим, как русский язык фиксировал бытовые детали и превращал их в семейную историю.