Фамилия Морунков образована от мирского имени или прозвища Морунко. В её основе лежит древнерусский глагол «морить», который имел два основных значения: «томить, утомлять, мучить» и «безмерно смешить». Эта двойственность и породила две версии происхождения фамилии, и обе имеют право на существование.

Первая версия относит имя Морунко к разряду охранительных именований. В древности родители, нарекая младенца таким именем, словно «отводили» от него настоящие беды. Считалось, что имя, означающее «мучитель» или «томитель», обманет злых духов, и те не тронут ребёнка, который на самом деле проживёт счастливую и безбедную жизнь. Подобная практика была широко распространена у славян, когда ребёнку давали имя с негативным оттенком, чтобы уберечь его от сглаза и несчастий.

Вторая версия видит в Морунко прозвище, отражающее характер его обладателя. Если глагол «морить» понимать как «смешить до упаду», то Морунко — это человек-балагур, весельчак, который мог «уморить» окружающих со смеху. Такое прозвище легко закреплялось за бойким и остроумным человеком и передавалось его потомкам.

Словообразовательная модель фамилии проста и типична для русского севера и северо-востока. Суффикс -ко в имени Морунко — характерная уменьшительно-ласкательная форма, распространённая в новгородских и вятских землях. Позже к этой основе добавился притяжательный суффикс -ов, который указывал на принадлежность: Морунков — то есть сын, потомок Морунко. Со временем форма закрепилась как фамилия.

Интересно, что фамилия Морунков встречается заметно реже, чем её «родственники» Морин или Морозов, что говорит о локальном бытовании исходного имени. Потомок человека по имени Морунко, где бы он ни жил — в тверской деревне или зауральском селе, — сохранил в своей фамилии память о предке, которого когда-то так необычно нарекли.