Фамилия Морункова образована от мирского имени или прозвища Морунко, и в её основе лежит древний глагол «морить». У этого глагола было два главных значения, и каждое из них по-своему объясняет происхождение именования. Первое значение — «томить, утомлять, мучить», второе — «безмерно смешить», то есть «морить со смеху». Оба смысла могли стать источником прозвища, но история у них разная.

Скорее всего, имя Морунко относится к охранительным, или обережным, именованиям. В старину родители нарекали ребёнка словом с отрицательным смыслом, чтобы отвести от него беды. Считалось, что злые духи не позарятся на того, кого уже назвали «мучителем» или «томителем», и не станут ему досаждать. Нарекая младенца Морунком, родные хотели, чтобы он прожил счастливую и безбедную жизнь: имя-оберег должно было обмануть нечистую силу и уберечь дитя от настоящих горестей.

Не исключено и второе прочтение: прозвище Морунко могло отражать характер взрослого человека, который любил и умел смешить окружающих. «Морить со смеху» — значит доводить до изнеможения хохотом, быть душой компании. В этом случае именование подчёркивало весёлый нрав и остроумие обладателя. Такая версия правдоподобна, но для фамилии, закрепившейся за родом, охранительная трактовка встречается чаще: обережные имена были массовым явлением, а шутливые прозвища реже переходили в официальные фамилии.

Суффикс -ун- в основе Морунко указывает на деятеля: так в русских говорах образовывали имена от глаголов, например, говорун, бегун, крикун. Морунко в этом ряду — тот, кто морит, в переносном смысле — либо утомляет, либо насмешит до слёз. Фамилия Морункова закрепилась в женской форме, а мужской вариант — Морунков. Потомки человека по имени Морунко со временем получили это родовое прозвание, и оно перешло к нам через несколько поколений.