Фамилия Мошанина образована от имени Мошан — просторечной, народной формы древнееврейского имени Моше, которое мы знаем как Моисей. Само имя восходит к египетскому корню и толкуется как «дитя» или «вынутый из воды» — в память о библейском сюжете, когда младенца спасли из Нила. В русских говорах библейские имена часто усекали и «обкатывали» до коротких, обиходных вариантов: так Моисей превращался в Мошана, а отчество от этого имени — в фамилию Мошанин. Для женщины форма Мошанина — это либо фамилия мужа, либо, что чаще встречается в документах, самостоятельное указание на род: дочь или жена Мошанина.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Мошанина буквально значит «дочь Мошана», а в мужском варианте — «сын Мошана». Такая модель типична для северных и центральных русских земель, где отчества на -ин образовывались от слов, оканчивающихся на -а или -я. Имя Мошан бытовало в крестьянской и рабочей среде, где церковное полное имя казалось тяжёлым и заменялось простым домашним прозвищем. Поэтому основатель рода, скорее всего, был выходцем из простонародья — крестьянином, ремесленником или посадским человеком, а не дворянином: в высших сословиях закрепились бы формы от полного имени, например Мосеев или Моисеев.

Интересно, что фамилия сохранила именно народное звучание, а не книжное. Если бы предка звали Мосей, мы бы получили Мосеина или Мосейкина, но форма Мошанин закрепилась в речи и передала более живой, разговорный облик имени. Встречаются и однокоренные фамилии — Мошанов, Мошагин, Мошков, но Мошанина выделяется тем, что прямо отсылает к конкретному личному имени, а не к прозвищу или профессии. Это редкий случай, когда в фамилии виден не род занятий, а личное имя предка, которое в быту звучало именно так — Мошан.