Фамилия Мошарин образована от прозвища или нецерковного имени Мошаря. Основа восходит к слову «мошкара», «мошка» — мелкое двукрылое насекомое. В русских говорах «мошарой» могли называть назойливого, надоедливого человека, того, кто «вьется» вокруг, не дает покоя. Но возможен и другой, более прозаичный вариант: «мошарить» в некоторых диалектах означало «медлить, копаться, возиться». Тогда Мошарей прозвали неторопливого, основательного человека, который делает все обстоятельно, но не быстро.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Мошарин — сын Мошари. Это типичная модель русских фамилий от прозвищ и имен на -а/-я. Встречается она повсеместно, но чаще всего в северных и центральных регионах России, где фамилии на -ин особенно распространены.

Стоит отметить, что в старых документах фамилия могла писаться через «а» — Машарин. Это не ошибка, а следствие акающего произношения, когда безударное «о» звучало как «а». В писцовых книгах и ревизских сказках XVII–XVIII веков можно встретить оба варианта, причем один и тот же человек в разных записях иногда фигурировал то как Мошарин, то как Машарин. Поэтому искать предков стоит по обеим формам.

Родственных фамилий с тем же корнем немного: Мошков, Мошковский, Мошкин. Но Мошарин стоит особняком — за счет редкого суффикса -ар- (сравните: Мошаря, как Толмач — Толмачёв, но здесь иная модель). Прозвище Мошаря — не частотное, а значит, фамилия могла возникнуть в одной локальной группе и долго не распространяться широко.

В сословном отношении Мошарины, скорее всего, крестьяне или посадские люди. Дворянских родов с такой фамилией в гербовниках не зафиксировано. Так что предки носителя этой фамилии — простые люди, получившие прозвище за характер или манеру поведения.