Фамилия Москотинин — одна из тех, что ставит исследователя перед выбором между очевидным и неожиданным. На первый взгляд, корень «москот» наводит на мысль о связи с Москвой: кто-то из предков мог быть москвичом или переселенцем из Москвы. Однако в русской ономастике фамилии на -инин, -янин обычно образуются от названий городов (Москвин, Тверитин, Вязьмитинов). Москотинин же имеет суффикс -ин, что указывает на иную природу основы — скорее на прозвище или профессию, чем на географию.

Наиболее правдоподобная версия отсылает к слову «москоть» — так в некоторых русских говорах называли москательные товары, то есть химические вещества, краски, лаки, клей. Слово это пришло из тюркских языков, где «москот» означало «краска», «румяна». Человек, торговавший такими товарами или занимавшийся окраской тканей, мог получить прозвище Москоть, а его потомки — фамилию Москотинин. В пользу этой версии говорит и суффикс -ин, типичный для фамилий, образованных от прозвищ на -а/-я: Москотинин значит «сын Москоти». Встречаются и однокоренные фамилии: Москотинов, Москотин, Москат.

Менее вероятно, но не исключено, что основа восходит к диалектному «москотать» — стучать, греметь, болтать. В таком случае прозвище Москота могли дать говорливому или суетливому человеку. Однако словари фиксируют это слово редко, и оно явно уступает «москоти» по распространённости в деловой письменности XVI–XVII веков.

Географически фамилия Москотинин встречается в основном в центральных и северных областях России — в Вологодской, Кировской, Ярославской, а также в Сибири, куда переселенцы уходили с Севера. Это косвенно подтверждает связь с ремеслом: в северных городах и сёлах красильное дело было развито, а купцы торговали красками и лаками. Сословно носители фамилии относились по большей части к крестьянам и мещанам, реже — к купечеству.

Таким образом, Москотинин — это не «москвич», а скорее «красильщик» или «торговец красками». Фамилия редкая, но прозрачная для этимолога, если не поддаваться соблазну прочитать в ней столичный след.