Фамилия Моссинова — женская форма, в основе которой лежит мужская фамилия Моссинов. А та, в свою очередь, образована от прозвища или нецерковного имени Мосс. В русской ономастике это достаточно редкий случай, когда основа не имеет очевидной славянской этимологии.

Самый вероятный путь происхождения — через тюркские языки. Слово «мосс» или «мос» в ряде тюркских наречий означает «лёд», «иней» или «холод». Прозвище Мосс могли дать человеку с холодным, сдержанным характером, либо, наоборот, родившемуся в студёную пору. Менее вероятна связь с греческим именем Мосх (от «телёнок»), которое встречалось в среде духовенства, но тогда фамилия выглядела бы как Мосхов или Мосхин.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Моссинов — «сын Мосса». Такая модель типична для фамилий, образованных от имён и прозвищ, оканчивающихся на твёрдый согласный. Удвоенная «с» в корне — скорее всего, результат позднего закрепления на письме; в живой речи фамилия могла произноситься и как Мосинов.

Географически фамилия тяготеет к южным регионам России и Поволжью, где исторически сильны тюркские влияния. Встречается она нечасто, и это как раз тот случай, когда редкая фамилия — не ошибка писаря, а сохранённое в веках прозвище, за которым стоит конкретная черта или обстоятельство.