Фамилия Мойсеенко отвечает на вопрос «чей ты?» и означает «сын Моисея». В основе лежит крестильное имя Моисей, которое пришло на Русь вместе с христианством из Византии. Само имя Моисей — древнееврейское, но, по наиболее распространённой версии, имеет египетские корни и переводится как «дитя» или «вынутый из воды». Второе значение связано с библейским сюжетом: младенца Моисея нашли в корзине на берегу Нила.

Мойсеенко — это не просто отсылка к библейскому пророку. Фамилия построена по типичной для украинской и белорусской традиции модели с патронимическим суффиксом -енко. Первоначально так называли сына, внука или вообще потомка человека по имени Мойсей — так в народе звучала церковная форма Моисей. Суффикс -енко в XVI–XVII веках закрепился на землях современной Украины как обозначение «малый», «молодой», то есть наследник отца. Позже это прозвание застыло и превратилось в наследственную фамилию.

Интересно, что в русском языке параллельно существовала форма с суффиксом -ов: Моисеев. Она строилась по великорусской модели и означала то же самое. Мойсеенко же — юго-западный, украинский вариант, который позже распространился по всей территории Российской империи вместе с переселенцами. Такое соседство однокоренных фамилий — Моисеев, Моисеенко, Мойсеенко, Мосейчук — показывает, как один и тот же корень обрастал разными окончаниями в зависимости от региона и местных языковых привычек.

Ударение в фамилии чаще падает на второй слог — Мойсéенко, хотя в некоторых семьях можно услышать и Мóйсеенко. На письме встречается двоякое написание: через «и» (Моисеенко) и через «й» (Мойсеенко). Обе формы законны, но вариант с «й» отражает более раннее народное произношение имени Мойсей, тогда как «и» — книжное, церковное.

Носители фамилии не принадлежали к какому-то одному сословию. Патроним на -енко носили и казаки, и крестьяне, и мещане. Фамилия не указывает на знатность рода, а лишь фиксирует имя родоначальника. В документах XVII–XVIII веков на Левобережной Украине Мойсеенки встречаются среди реестровых казаков, но это не значит, что все носители фамилии — потомки казацкой старшины. Чаще это были рядовые селяне, чьи предки носили имя Мойсей.