Фамилия Мойсеец — редкий случай, когда перед нами не просто отчество, а прозвище, застывшее в форме существительного. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий на -ов, -ин или -ский, Мойсеец не говорит «чей сын» или «откуда родом». Она отвечает на вопрос «кто?». Такой тип образования (так называемые «именные» или «прозвищные» фамилии) встречается в основном в украинской и белорусской традиции, а в русской — гораздо реже, чаще всего в южных областях, где было сильное влияние малороссийского говора.

Основа фамилии — каноническое имя Моисей (в просторечии Мойсей). Суффикс -ец выполняет здесь ту же роль, что и в словах «купец», «ловец» или «гонец»: он обозначает лицо по действию или свойству. В случае с именем Мойсеец — это «человек, которого зовут Моисей» или, что вероятнее, «человек, который служит при церкви Моисея» или «чтец жития Моисея». В украинских говорах суффикс -ец мог прикрепляться к имени для обозначения ученика, последователя или носителя характерной черты, связанной с этим именем.

Есть и вторая версия, более прозаичная. На юго-западе Российской империи, особенно в Подолье и на Волыни, Мойсеец могло быть не фамилией, а прозвищем, данным человеку, который жил на земле, арендованной у некоего Моисея, или происходил из села, названного в честь святого. Однако объяснение через прозвище «маленький Моисей» или «сын Моисея» проигрывает по распространённости: для прямого отчества украинцы использовали бы форму Мойсейчук или Мойсеенко.

Словообразовательная модель показывает, что фамилия не дворянская и не крестьянская в привычном понимании. Такие «именные» фамилии на -ец чаще всего получали казаки, мещане или церковнослужители низшего ранга — дьячки, пономари. В реестрах Войска Запорожского встречаются прозвища вроде Мойсей, но форма Мойсеец — более поздняя фиксация, уже в метрических книгах XIX века. Географически фамилия привязана к современной западной Украине и югу Беларуси, в России она практически не встречается.

Таким образом, предки носителя фамилии Мойсеец — скорее всего, выходцы из западнорусских земель, носившие прозвище, образованное от имени Моисей, возможно, с оттенком «служитель» или «малый Моисей». Фамилия сохранила архаичную модель именования и не прошла типичную для великорусских фамилий унификацию через суффикс -ов.