Фамилия Мойсеяха — одна из тех, что сразу выдают географию своего происхождения. Её редкий суффикс -аха указывает на северорусский ареал, а именно на Архангельскую область и, в первую очередь, на Русский Север. Такие фамилии на -аха, -яха, -уха (сравните: Булаха, Гуляха, Шумиха) в XVII–XIX веках были типичны для крестьянского населения Поморья и Прионежья. Они образовывались от прозвищ или имён и закреплялись за целым родом, не меняя формы по родам — то есть Мойсеяха одинаково относилась и к мужчине, и к женщине.

В основе фамилии лежит имя Мойсей — просторечная форма канонического имени Моисей. В бытовой речи северных крестьян имя нередко «укорачивали» или «переделывали» на свой лад, отсюда и Мойсей вместо Моисей. К основе Мойсей- добавился суффикс -ях-, который в местных говорах выполнял роль уменьшительно-пренебрежительного или просто обиходного. Получается, что Мойсеяха — это «человек из рода Мойсея» или «тот, кого в деревне звали Мойсейкой». Фамилия застыла в форме, которая в современном языке звучит как женская, но исторически это общая родовая метка.

Стоит отметить, что фамилия не получила широкого распространения за пределами Севера. В центральных и южных губерниях России она почти не встречается — там преобладали модели на -ов, -ев, -ин. Мойсеяха — яркий пример того, как локальная языковая традиция породила уникальную фамилию, которую и сегодня можно встретить почти исключительно у потомков архангельских или вологодских крестьян. Никакого отношения к еврейской среде, несмотря на библейское имя Моисей, фамилия не имеет — это чисто русское северное образование.