Фамилия Можерин — одна из тех, где на первый взгляд ясная основа при ближайшем рассмотрении даёт несколько вариантов толкования. В ней слышится что-то «можжевеловое» или «могучее», но лингвистика предлагает более точные версии.

Корень фамилии — «Можер». Это прозвище или неканоническое имя, которое могло образоваться двумя путями. Первый: от диалектного глагола «можерить» или «можорничать» — в некоторых говорах так говорили о человеке, который делает что-то с трудом, через силу, либо о том, кто капризничает, привередничает. Второй вариант: основа связана с тюркским словом «можар» (так называли народность, родственную венграм, — мадьяр, или просто «воин»). В русских землях прозвище «Можар» могли дать выходцу из этих мест или человеку с восточными чертами.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Можерин — это «сын Можеры» или «человек из семьи Можеры». Такая модель типична для фамилий, образованных от прозвищ на -а/-я, и закрепилась в основном в северных и центральных областях России. Географически фамилия редкая, встречается точечно, чаще всего в Поволжье и на юго-востоке, что косвенно подтверждает версию о тюркском следе: именно в этих регионах русские активно контактировали с татарами, башкирами и другими народами.

Интересно, что фамилия Можерин не связана с «можжевельником» напрямую, хотя народная этимология часто подтягивает это сходство. В старых документах форма «Можер» могла писаться и как «Можар», а в некоторых говорах «можерой» называли крепкого, плотного человека. Таким образом, родоначальник Можериных мог быть либо придирчивым хозяином, либо выходцем с востока, либо просто коренастым мужиком — точное значение утрачено, но круг возможных значений довольно узок.