Фамилия Мугин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Мугин послужило мирское имя Муга. Скорее всего, фамилия Мугин происходит от нецерковного имени Муга, в основе которого лежит диалектное слово «муга»: так в поволжских говорах называют змею. Они обитают в глухих пещерах и ущельях, остерегаются воды, а палаты их сверкают золотом и серебром, бесценными камнями. Согласно другой, менее правдоподобной гипотезе, фамилия Мугин образована от тюркского имени Мугин, которое в переводе означает «хороший помощник» или «воспоминание». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Муга, со временем получил фамилию Мугин. О точном месте и времени возникновения фамилии Мугин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Мугин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.