Фамилия Мухарева — женская форма фамилии Мухарев, которая образована от прозвища Мухарь. В русских говорах «мухарь» — это, во-первых, человек, который любит ловить мух или постоянно от них отмахивается (прозвище по бытовой привычке), а во-вторых, так могли назвать надоедливого, назойливого человека, который «жужжит» как муха. Есть и третье, более редкое значение: в некоторых диалектах «мухарь» — это охотник на мух, то есть паук-сенокосец, и прозвище могло достаться суетливому или длинноногому человеку.

Словообразовательная модель проста: к основе «мухарь» добавили типичный русский суффикс принадлежности -ев, указывающий на родство (чей? — Мухарев, то есть сын Мухаря). Такая модель характерна для крестьянских и мещанских фамилий центральной России. Суффикс -ев (а не -ов) стоит после мягкой основы (мухарь), что грамматически верно.

В отличие от более известной фамилии Мухин (от «муха»), Мухарев встречается реже и имеет более конкретную прозвищную природу. Если Мухин мог произойти и от мирского имени Муха (в дохристианской традиции), то Мухарь — почти всегда прозвище, данное за поведение или внешность. В документах XVII–XVIII веков, например в переписных книгах, встречаются крестьяне с прозвищем Мухарь в новгородских и вятских землях, что указывает на севернорусский ареал фамилии.

Таким образом, предок носительницы фамилии Мухарева был человеком, которого в деревне прозвали Мухарем — возможно, за назойливость, суетливость или за то, что он постоянно отмахивался от мух. Фамилия недворянская, а крестьянская или посадская, и её смысл лежит в бытовой наблюдательности русских людей.