Фамилия Мухарский образована от имени Мухар (Мухара). По одной из версий, оно восходит к монгольскому слову «мухар» - «благочестие». Согласно другой гипотезе, это имя связано с карачаево-балкарским словом «мухар» - «обжора». В таком случае можно предположить, что это имя изначально представляло собой прозвище, которое мог получить человек, любивший плотно покушать. Позднее на базе прозвища возникло имя Мухар с тем же значением, но не связанное с привычками человека. Скорее всего, фамилия Мухарский является украинской: на это указывает суффикс -ский. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Мухарских можно лишь на основании генеалогических исследований.