Фамилия Мухонкин, предположительно, образована от имени Мухонка, которое может быть производной формой имени Мухаммет. Оно в переводе с арабского языка на русский означает «восхваляемый, прославляемый». Возможно также, что имя Мухонка является производной формой имени Мухан. Оно в переводе с арабского языка означает «работник, наемный работник». Таким образом, потомок человека, которого звали Мухонка, со временем получил фамилию Мухонкин. Так, в документах Ленинградского происхождения упоминается татарин Давлед Малекович Мухонкин, родившийся в 1888 году в деревне Аллагулово Краснослободского уезда Пензенской губернии.