Фамилия Мухоркины — редкий случай, когда основа просматривается почти прозрачно, но точное значение ускользает из-за диалектной пестроты. Корень здесь — «мухор», и в разных говорах он мог означать совершенно разные вещи. Самая прямая и прозаическая версия: мухором в некоторых областях называли мелкую, неказистую вещь, кроху, остаток. Прозвище Мухорок могли дать невысокому, щуплому человеку или, наоборот, тому, кто постоянно жаловался на недостаток, «мухорил» — скупился, крохоборничал. Однако есть и другая, более неожиданная линия: в сибирских и уральских говорах «мухор» — это заморённая, худая лошадь, кляча. Тогда предок-Мухорок мог быть конюхом, барышником или просто владельцем такой лошади, что на селе было заметной приметой.

Суффикс «-ин» в фамилии Мухоркины указывает на принадлежность: «чей?» — Мухоркин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Мухорок. Форма множественного числа (Мухоркины) — это традиционное семейное имя, которым в документах записывали целый род. Интересно, что фамилия почти не встречается в центральных областях России; её очаги — на Вятке, в Пермском крае и в Зауралье. Это совпадает с ареалом слова «мухор» в значении «лошадь-маломерок»: именно в этих краях была развита особая порода мелких, но выносливых вятских лошадей.

Словообразовательная модель проста: основа «мухор» плюс уменьшительный суффикс «-ок» (Мухорок) и далее притяжательный «-ин». Встречаются однокоренные фамилии Мухорин, Мухоров, Мухортов — последняя, кстати, напрямую связана с конским прозвищем (мухортый — масть лошади, рыжая с чёрным хвостом и гривой). У Мухоркиных такой маститой параллели нет, что делает их фамилию более «личной» — прозвище могло закрепиться за конкретным человеком по внешности или характеру, а не по профессии.

Дворянских родов с этой фамилией не известно. Мухоркины — почти наверняка крестьянский род, причём, судя по географии, из числа государственных или бывших монастырских крестьян северо-востока России. В переписных книгах XVII–XVIII веков такие прозвища нередко фиксировали как уличные, а уже в XIX веке они превратились в наследственные фамилии. Так что Мухоркины — это не про знатность, а про меткое слово, которое когда-то приклеилось к предку и осталось с родом на века.