Фамилия Мухтарулин — редкий пример того, как длинное и сложное восточное имя превратилось в привычную русскую фамилию. В её основе лежит мужское имя Мухтарулла, и чтобы понять смысл фамилии, нужно разобрать это имя по частям.

Первая часть — арабское имя Мухтар, которое переводится как «выбранный» или «избранный». В мусульманской традиции это один из эпитетов пророка Мухаммеда, поэтому имя считалось почётным. Вторая часть — «улла», форма арабского слова «Аллах». Соединившись, эти части дают имя Мухтарулла со значением «избранный слуга Аллаха» или просто «избранный Аллахом».

Родители, нарекавшие сына Мухтаруллой, вкладывали в это имя пожелание: чтобы ребёнок вырос достойным мусульманином, верным и уважаемым человеком. Такое имя было не просто личным именем, а своего рода благословением и наказом.

Сама фамилия образовалась по типичной для русской ономастики модели. Имя Мухтарулла при присоединении русского суффикса принадлежности -ин дало форму Мухтаруллин, которая со временем в произношении упростилась до Мухтарулин. Суффикс -ин в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — Мухтарулин, то есть сын, потомок Мухтаруллы.

Интересно, что фамилия сохранила почти полную форму исходного имени, что делает её легко узнаваемой и отличает от более коротких вариантов вроде Мухтаров. Такая полнота — признак того, что фамилия закрепилась в письменных документах относительно поздно, когда имя уже устоялось в полной форме. Носители фамилии Мухтарулин, скорее всего, происходят из татарской или башкирской среды, где подобные теофорные имена (содержащие имя Бога) были широко распространены.