Фамилия Мухтаруллина — женская форма фамилии Мухтаруллин, которая ведет родословную от мужского тюркского имени Мухтарулла. Корень здесь — арабское имя Мухтар, означающее «выбранный, избранный». В составе сложного имени Мухтарулла к нему присоединяется «улла» — форма арабского слова «Аллах». Поэтому полное значение имени — «избранный слуга Аллаха», «избранный Аллахом».

Такое имя было распространено в мусульманской среде, и родители, давая его сыну, вкладывали в него пожелание, чтобы ребенок вырос достойным верующим, оправдывающим высокое звание избранного. Сама модель образования фамилии — прибавление к имени отца русского патронимического суффикса -ин, который отвечает на вопрос «чей?». То есть Мухтаруллин буквально означает «сын Мухтаруллы». Позже, когда фамилия закрепилась официально, она перестала быть простым указанием на отца и стала родовым именем, передающимся по наследству.

Фамилия Мухтаруллина хранит в себе не только имя конкретного предка, но и память о культурной и религиозной традиции, в которой это имя возникло. Она относится к пласту фамилий, образованных от теофорных имен, то есть содержащих в себе имя Бога, что было характерно для многих народов, исповедующих ислам. Для носительницы фамилии это не просто набор букв, а сжатая формула происхождения, связывающая её с предком, чьё имя было призвано определить его жизненный путь.