Фамилия Муллакаева ведет свое начало от арабского слова mella, т.е. В данном случае к имени добавился уменьшительно-ласкательный аффикс –кай. Вероятно, родители, нарекая ребёнка именем Муллакай, желали своему сыну стать достойным мусульманином. К известным представителям данной фамилии относится Кидряс Муллакаев - башкирский старшина Кара-Табынской волости Ногайской дороги Уфимской провинции. Во время путешествия Екатерины II по Волге в 1767 году Кидряс был принят императрицей в Казани и награжден званиями главного старшины и тархана. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Муллакаевых можно лишь на основании генеалогических исследований.