Фамилия Муллякаева — женская форма фамилии Муллякаев, которая встречается в основном среди татар и башкир. Её основа — мусульманское имя Муллакай, которое в свою очередь образовано от арабского слова «мулла» (учёный, духовное лицо, учитель) с помощью тюркского уменьшительно-ласкательного суффикса -кай. Получается «маленький мулла» или «сын муллы». Имя Муллакай давали мальчикам в семьях, где отец был муллой, либо как пожелание, чтобы ребёнок вырос образованным и уважаемым человеком.

Фамилия построена по типичной для тюркских народов модели: имя + патронимический суффикс -ев/-ев, который в русской среде закрепился при оформлении фамилий. В татарской традиции фамилии на -ев (а не на -ин) — обычное дело, и здесь нет указания на русское происхождение, только на способ адаптации в документах имперского периода.

Интересно, что в отличие от многих фамилий, которые восходят к конкретному ремеслу или черте характера, Муллякаева прямо отсылает к социальному статусу. Мулла в татарском и башкирском обществе — не просто священник, а часто и учитель, судья, грамотей. Носитель фамилии мог быть потомком сельского муллы, который вёл приход и учил детей Корану. Встречаются и варианты написания — Муллакаев, Муллякаев, но разница только в произношении и записи (двойное «л» или одно).

С географией фамилия связана с регионами компактного проживания татар: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская, Челябинская, Ульяновская области. Встречается и у казанских татар, и у мишарей. Точных цифр по числу носителей нет, но фамилия не массовая, скорее редкая — в пределах нескольких сотен семей на всю Россию.