Фамилия Муллахунов имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Муллахунов уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Муллахунов являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Муллахунов образована от имени Муллахун, которое состоит из двух частей. Вторая часть имени — «хун» — в переводе с иранского означает «родник». Однако существует гипотеза, что этот компонент восходит к тюркскому слову «хан» - «правитель». Таким образом, имя Муллахун можно перевести как «наставник-правитель». Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Муллахунов способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Муллахунов представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.