Фамилия Мункуев — один из ярких примеров того, как русская фамилия может быть образована от нерусского имени, сохранив при этом свою узнаваемую словообразовательную модель. В основе лежит бурятское или монгольское имя Мунку (Мункэ, Мунх), что в переводе означает «вечный», «бессмертный». Имя это было широко распространено у бурят, калмыков и монголов, особенно в буддийской традиции, где «вечность» — одна из ключевых категорий.

С точки зрения морфологии, фамилия построена по классическому русскому патронимическому типу: к основе Мунку- добавлен суффикс -ев. Суффикс указывает на принадлежность («чей?») — буквально «сын Мунку». Это типичная модель для фамилий, возникших на стыке культур: русская администрация фиксировала инородцев по отчеству, превращая имя отца в наследственную фамилию. В отличие от фамилий на -ов, которые чаще образовывались от основ на твердый согласный, -ев здесь появился из-за конечного гласного в имени Мунку (по правилу, после мягких согласных и шипящих пишется -ев).

Географически фамилия Мункуев почти целиком привязана к Восточной Сибири, прежде всего к Бурятии и Иркутской области, а также к Забайкальскому краю. Встречается она и у калмыков, но реже. Это фамилия не дворянская и не купеческая — она бытовала в среде простых скотоводов и крестьян-бурят, которые в XIX — начале XX века получали фамилии при записи в метрические книги или при переходе на оседлость. Важно, что фамилия не прошла через сословную призму: её носители в массе своей относились к податным сословиям, и никаких известных дворянских родов с такой фамилией не существовало.

Встречаются варианты написания Мункуев и Мункуев, но нормативным считается первый (через «у» после «н»). В редких случаях фамилию могли записать как Мункуев, если в основе лежало имя Мунку с долгим гласным, но это скорее исключение. Однокоренные фамилии — Мункин, Мунков, Мункужинов — образованы от тех же корней, но с разными суффиксами, и тоже указывают на бурятское или монгольское происхождение.