Фамилия Муратока — редкий случай в русском ономастиконе. Её происхождение почти наверняка не славянское, и в ней не работают привычные модели с суффиксами -ов, -ин или -ский. Основа «Мурат» — это арабское имя Мурат (مراد), означающее «желанный», «цель», «стремление». В тюркских языках, особенно у татар, башкир, казахов и народов Кавказа, имя Мурат (или Мурад) было очень распространено. Фамилии на «-ока» для русского уха звучат необычно, но именно этот суффикс или окончание может указывать на конкретный регион бытования.

Скорее всего, Муратока — это русифицированная форма фамилии, которая в исходном варианте звучала как Муратов, но подверглась изменению под влиянием местных говоров или при переписи. В некоторых диалектах русского языка, особенно на юге и в Поволжье, фамилии могли записывать с окончанием «-ока» вместо привычного «-ов». Например, вместо Муратов — Муратовка, а потом сокращённо — Муратова, но форма «Муратока» встречается и как самостоятельное образование. Вторая версия, более экзотическая, — что «ока» — это часть сложного тюркского имени или прозвища, где «мурат» соединилось с «ока» (в значении «стрела» или «меткий»), но такая гипотеза не подкрепляется массовыми данными.

Географически фамилия Муратока может быть локализована в районах смешанного русско-татарского населения — например, в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской области. Встречается она крайне редко, поэтому точное число носителей назвать сложно. Социально предки носителя этой фамилии, вероятно, были крестьянами или мещанами, принявшими православие или оставшимися в мусульманской среде, но получившими фамилию по отцу — Мурату. В любом случае, основа фамилии — имя, которое носил основатель рода, и в этом смысле она ничем не отличается от тысяч других русских фамилий, образованных от личных имён, хоть и с необычным окончанием.