Фамилия Муругин — одна из тех, где ключ к разгадке лежит не в имени, а в прозвищной основе, связанной с внешностью или мастью животного. У неё редкий, но прозрачный корень.

В основе фамилии лежит прилагательное «муругий». В русских говорах и в языке охотников так называли животных с определённым окрасом: рыже-бурым, тёмно-рыжим, часто с чёрным отливом или тёмной полосой вдоль хребта. Чаще всего слово применяли к собакам, лошадям и кошкам. Человек, получивший прозвище Муругий, скорее всего, выделялся смуглой кожей, тёмными волосами или рыжеватым оттенком волос и бороды. Встречается и другая, менее распространённая версия: в некоторых диалектах «муругий» означало «угрюмый», «суровый», «нахмуренный». Однако первая трактовка — по цвету — главная и подтверждается множеством аналогичных фамилий-«мастей» (Чернов, Рыжов, Буров, Кауркин).

Словообразовательная модель проста: от основы «муруг» через суффикс притяжательного прилагательного -ин образована фамилия Муругин. Суффикс -ин в русских фамилиях отвечает на вопрос «чей?» и указывает на принадлежность: сын Муругого, потомок человека с прозвищем Муругий. Такая модель типична для прозвищ, оканчивающихся на -а/-я или на мягкий согласный (сравните: Кузьмин, Ильин, Птицын).

Фамилия редкая и имеет чёткую географическую привязку. По данным переписей и архивов, основная зона её бытования — Поволжье, особенно Нижегородская область, а также соседние районы Чувашии и Марий Эл. Встречается она и на Урале, куда переселенцы могли принести её в XVII–XVIII веках. За пределами этих регионов Муругины — единичные случаи.

Социальный состав предков, скорее всего, был крестьянским. Прозвища по масти шерсти или цвету волос давали в среде, где человека описывали наглядно, без отвлечённых понятий. Фамилия не дворянская и не духовная: в среде духовенства чаще образовывали фамилии от названий церквей или латинских корней. Муругин — это «деревенская» фамилия, возникшая в среде крестьян или посадских людей не позднее XVII — начала XVIII века.

Если сравнивать с однокоренными, то фамилия Муругин стоит в одном ряду с Муруговым и Муруговским. Разница в суффиксах: -ов образует фамилию от прозвища на твёрдый согласный (Муруг, а не Муругий), а -ский — более поздняя, «географическая» модель, указывающая на выходца из места с названием Муругово или Муруги. Самой же органичной и древней формой является именно Муругин, так как она прямо наследует полное прозвище в именительном падеже.