Фамилия Мурзомуратова — редкий пример двойной тюркской основы, где соединились два титульно-именных компонента. Первая часть, «мурза», восходит к персидскому «мирза» (эмир-заде — «княжич, сын эмира»). В тюркской среде, особенно у татар и башкир, мурзой называли представителя знати, часто военного предводителя или писца. Вторая часть, «Мурат» (араб. Murād — «желанный, цель»), — распространённое мужское имя, которое в исламском мире давали в честь пророка или как пожелание счастливой судьбы. Таким образом, Мурзомуратов — это «мурза по имени Мурат» или «князь Мурат», а фамилия образована от полного имени-прозвища предка.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий тюркского происхождения: к основе на твёрдый согласный добавили суффикс -ов, а женский вариант — Мурзомуратова — получил окончание -а. Такая конструкция характерна для фамилий, которые закрепились в XIX веке, когда оседлые тюркские народы, особенно татары и башкиры, начали массово получать фамилии по отцу или деду. Двойные имена вроде Мурзомурат — не редкость в ономастиконе Поволжья и Приуралья: они подчёркивали социальный статус (мурза) и личное имя, что было удобно для идентификации в среде, где титулы ещё имели вес.

Географически фамилия тяготеет к территориям бывшего Казанского ханства и Башкортостана. Встречается она редко, что указывает на её локальное происхождение — возможно, от конкретного рода или селения, где жил знатный человек по имени Мурат. В переписях XIX века такие фамилии фиксировали у тептярей, мишарей и служилых татар, которые сохраняли сословную память о мурзах.

Спорных версий немного: иногда первую часть путают с русским словом «мурза» в значении «грязнуля» (от татарского «мырза» — «неряха»), но это народная этимология. Для носителя фамилии Мурзомуратова исторически более вероятно происхождение от уважаемого предка-мурзы, а не от прозвища за неопрятность. Если и есть альтернатива, то она касается возможного влияния кавказских языков, где «мурза» также бытует как титул, но для русской фамилии татарский след убедительнее — именно в тюркской среде двойные имена с «мурзой» были системой.

Коротко: предки носителя фамилии, скорее всего, были служилыми или торговыми людьми из знатного татарского или башкирского рода, а сама фамилия возникла как отчество от полного имени, где титул встал перед личным именем.