Фамилия Мурзамуратова — редкий пример двойной тюркской основы, склеенной в одно целое. Она составлена из двух самостоятельных имён-прозвищ: «мурза» и «мурат». Первая часть, мурза, восходит к персидскому «мирза» — «сын эмира», «князь», «господин». В тюркской среде так называли знатных людей, грамотных писцов или просто уважаемого человека. Вторая часть, мурат, — арабское имя Мурад («желанный», «цель»), широко распространённое у народов, исповедующих ислам. Соединение двух имён в одну фамилию — не редкость для татарской и башкирской ономастики: так подчёркивали родство сразу с двумя предками или фиксировали составное прозвище, которое закрепилось за основателем рода.

Суффикс -ов (в женском варианте -а) — стандартный русский патронимический формант, который добавили к тюркской основе при оформлении фамилии в XIX–XX веках. По модели образования Мурзамуратова стоит в одном ряду с такими фамилиями, как Мурзагалиев, Мурзабеков или Муратов. Однако двойная основа встречается реже, что делает фамилию более локальной и привязанной к конкретному роду.

Географически фамилия тяготеет к регионам с компактным проживанием татар и башкир: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская, Челябинская области. Встречается также у ногайцев и карачаевцев, но в меньшей степени. Социальный контекст: носители фамилии в прошлом могли принадлежать к служилому сословию или духовенству, так как компонент «мурза» часто указывал на происхождение от мелких феодалов или уважаемых родов. Однако не исключено, что прозвище дали просто грамотному или влиятельному человеку в деревне — титул «мурза» со временем потерял строгую сословную привязку.

Спорных версий у этой фамилии немного. Иногда первую часть ошибочно выводят из русского слова «мурза» (грязнуля), но это народная этимология: в тюркской среде «мурза» никогда не имело отрицательного значения. Другая версия — что «мурза» здесь вариант имени Мирза, но в составе фамилии это не меняет смысла. Правдоподобнее всего считать Мурзамуратова сложением двух равноправных имён, а не прозвища и имени.

В документах фамилия фиксируется с конца XIX века, в основном в метрических книгах Оренбургской и Уфимской губерний. Известных носителей в публичном пространстве немного, что типично для редких сложных фамилий.