Фамилия Мусафирова — женская форма фамилии Мусафиров, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса. Суффикс «-ов» указывает на типичную русскую модель образования от отчества или прозвища: Мусафир → сын Мусафира → Мусафиров. Женский вариант, соответственно, закрепился за дочерью или женой.

Основа фамилии — слово «мусафир». В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) «мусафир» означает «путник», «странник», «гость». Слово пришло из арабского через персидское посредничество. Таким образом, прозвище Мусафир могли дать человеку, который много путешествовал, был пришлым, либо, наоборот, гостеприимному хозяину, часто принимавшему гостей.

В русском контексте фамилия Мусафиров/Мусафирова — почти наверняка тюркского происхождения. Носители такой фамилии — потомки выходцев из татарской или башкирской среды, которые в разное время переходили в православие и получали фамилии по своим старым прозвищам. Встречается фамилия в Поволжье, на Урале и в регионах с татарскими диаспорами.

Интересная деталь: в отличие от более частых русских фамилий на «-ин» (от основ на -а, -я), суффикс «-ов» здесь — знак, что основа воспринималась как мужская и заканчивалась на твёрдый согласный. В татарском языке слово «мусафир» — мужского рода, поэтому фамилия и получила форму на «-ов», а не на «-ин».

Если искать однокоренные фамилии, это Мусафировы (без варианта) и, возможно, упрощённые формы вроде Сафиров, но там уже другой корень — от имени Сафиулла. Мусафирова стоит особняком: редкая, с прозрачной этимологией, но нечастым исходным словом. Встречается она не массово, и её носители, скорее всего, могут проследить свои корни до татарских или башкирских предков, получивших фамилию в XIX веке при переписях населения.