Фамилия Мусаварова — редкая и неоднозначная. На первый взгляд в ней слышен восточный или кавказский отпечаток: основа «Муса» — это арабское имя (библейский Моисей в исламской традиции), широко распространённое у тюркских и кавказских народов. Второй компонент «-вар» может быть искажением персидского «вар» (обладающий, несущий) или тюркского суффикса со значением «делающий». Таким образом, буквально «Мусаварова» могла означать «принадлежащая Мусавару» или «дочь/жена того, кто связан с Мусой».

Но решающую роль играет суффикс «-ова», который в русской ономастике однозначно указывает на женскую форму фамилии, образованную от мужской — Мусаваров. Это значит, что носительница — женщина, а её предок по мужской линии носил фамилию Мусаваров. Сама же модель «Мусаваров» типична для русифицированных фамилий нерусских народов: к восточному корню добавили русский патронимический суффикс «-ов», что делало фамилию грамматически удобной для документов Российской империи.

Географически фамилия встречается в основном в регионах с сильным азербайджанским, дагестанским или татарским влиянием, а также в среде горских евреев. Вторая версия происхождения связывает фамилию не с именем, а с прозвищем «Мусавар» — так в некоторых тюркских диалектах называли художника или рисовальщика (от арабского «мусаввир» — «создающий образы»). В этом случае предок мог быть живописцем, иконописцем или мастером орнамента.

Точную этимологию без семейных преданий и архивов установить сложно, но ясно одно: фамилия Мусаварова — типичный пример того, как восточное имя или ремесло «обрусело» через суффикс, сохранив при этом свою узнаваемую основу.