Фамилия Мушер почти наверняка имеет немецкие корни, и в её основе лежит прозвище, а не имя. Прямой ответ на вопрос о происхождении: так могли называть выходца из местечка Муш (Mosch) в Айфеле — цепи невысоких гор на западе Германии. Название поселения переводят с немецкого как «трясина» или «болото», а компонент «-ер» в таких фамилиях традиционно указывает на принадлежность к месту: Мушер — тот, кто родом из Муша.

Но есть и вторая версия, которую не стоит сбрасывать со счетов. В немецком и датском языках существует слово, близкое по звучанию к «мушер», которое означает «воробушек». В этом случае прозвище могло отражать не географию, а внешность или характер. Так могли прозвать маленького, юркого, подвижного человека, который чем-то напоминал шуструю птичку. Эта версия кажется даже более живой, если представить, как в быту закреплялось бытовое прозвище, а не сухое указание на место рождения.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная: основа «муш» плюс продуктивный суффикс «-ер». В немецкой ономастике такой способ образования фамилий встречается постоянно, и он вполне сопоставим с русскими фамилиями на «-ов» или «-ин», которые тоже отвечали на вопрос «чей ты» или «откуда». Важно, что обе версии не противоречат друг другу: и топонимическая, и прозвищная гипотезы опираются на реальные языковые факты.

Если опираться на логику, то версия с «воробушком» выглядит чуть правдоподобнее для прозвища, потому что топоним Муш в Айфеле — местечко небольшое и малоизвестное, вряд ли оно массово породило фамилию. А вот ласковое или ироничное прозвище «воробушек» могло возникнуть независимо в разных немецких землях. Впрочем, для конкретной семьи ответ может быть иным: без генеалогического исследования точно сказать, какая из версий сработала у ваших предков, нельзя.

В написании фамилии обращает на себя внимание сочетание «ш» с последующей «е» — для немецкого языка типично написание Moscher или Muscher, где «sch» передаёт тот самый звук «ш». В русской передаче фамилия закрепилась в краткой форме «Мушер», что тоже говорит о её иностранном происхождении: исконно русские фамилии с таким финальным сочетанием встречаются крайне редко.

Что касается географии, то фамилия Мушер в России редкая. Её носители, скорее всего, потомки немецких колонистов, переселявшихся в Поволжье, Причерноморье или на Кавказ в XVIII–XIX веках, либо люди, чьи предки приехали позже. Иногда такие фамилии встречаются и в среде балтийских немцев. Сословная принадлежность могла быть разной — от ремесленников до крестьян, но утверждать что-то конкретное без архивных данных не стоит.