Фамилия Мушер образована от аналогичного прозвища, восходящего к топониму Муш. Так называется местечко, расположенной в Айфеле - цепи гор средней высоты на западе Германии. Название Муш в переводе с немецкого языка означает «трясина, болото». Компонент –ер является суффиксом принадлежности. Так могли назвать выходца из Муша. Возможно также, что прозвище Мушер этимологически связано с аналогичным немецко-датским существительным в значении «воробушек». Скорее всего, именование Мушер отражает особенности внешности его обладателя. Так могли назвать маленкого и юркого человека.