Фамилия Муслидин — редкий случай, когда основа не славянского, а арабского происхождения, но оформлена по русской словообразовательной модели. В этом её главная особенность.

Корень фамилии — имя Муслидин, которое восходит к арабскому «Мусліх ад-Дін» (муслих ад-дин) — «благодетель веры», «устроитель религии». В исламской традиции это составное теофорное имя, одно из многих, где вторая часть (-ад-дин) означает «вера», «религия». В русском языке такое имя прижилось в усечённой форме: конечное «ад» отпало, осталось Муслидин, которое и стало основой фамилии.

Фамилию образовали с помощью типичного русского патронимического суффикса -ов. По модели «Муслидин + ов» получилась фамилия, буквально означающая «сын Муслидина» или «принадлежащий роду Муслидина». Такая модель — самая распространённая в русских фамилиях, но здесь она наложилась на арабское имя, что указывает на среду бытования: фамилия могла сложиться у народов Северного Кавказа, Поволжья или Средней Азии, где арабские имена были распространены, а русская административная система требовала оформления фамилий по единому образцу.

Носители фамилии Муслидин — это, скорее всего, потомки человека, которого звали Муслидин. Поскольку имя не было крестьянским или простонародным в русской среде, предок мог быть муллой, учителем, судьёй или просто уважаемым человеком в мусульманской общине. Фамилия не указывает на конкретное ремесло или сословие, но говорит о религиозном и культурном контексте её возникновения.

Встречается фамилия преимущественно в республиках с мусульманским населением — в Дагестане, Чечне, Татарстане, Башкортостане, а также среди таджиков и узбеков, у которых фамилии на -ов закрепились в советское время. Вариант написания без суффикса — просто Муслидин — тоже возможен, но он реже и указывает на то, что фамилию не русифицировали, а оставили как есть.