Фамилия Мусская — редкий случай, когда географическая основа почти наверняка перевешивает прозвищную. При взгляде на неё сразу бросается суффикс -ск-, типичный для фамилий, образованных от названий местности. В русской традиции такую модель чаще всего получали дворяне по имени своего поместья (князья Волконские, Трубецкие) или выходцы из сёл и городов, чьи фамилии закрепились за крестьянами и мещанами позже, в XIX веке.

Корень «Мус-» надёжнее всего связывать с рекой Мусской. В России известно несколько речек с таким названием, особенно на севере и северо-западе, например, в бассейне Онеги или в Архангельской области. Человек, живший на берегу такой реки или в селе Мусское, Мусская, получал прозвание «Мусский» — то есть «с Мусской реки». Переселяясь в другую волость или город, он сохранял это указание на родину, и оно становилось фамилией.

Менее вероятна, но допустима версия от древнерусского нецерковного имени Муса (от греческого «муза»). В старину такие имена давали как пожелание таланта или в честь античных покровительниц искусств, но они были крайне редки. Если бы фамилия пошла от этого имени, мы бы ожидали форму «Мусин» или «Мусов», а не «Мусский». Суффикс -ск- притягивает к географическому объяснению сильнее.

С точки зрения социальной истории, носители фамилии Мусская вряд ли принадлежали к высшей аристократии — княжеских родов с таким именем не известно. Скорее всего, это потомки государственных или монастырских крестьян, которые в XVIII–XIX веках получили фамилию по месту прежнего жительства при переписях. Фамилия сохранила свою редкость: она не разошлась широко, а осталась локальной, что косвенно подтверждает её «привязку» к конкретному небольшому региону.

Таким образом, Мусская — это типичная «топонимическая» фамилия, которая говорит не о занятии или внешности предка, а о том, откуда он родом: с реки или из села, носившего название с корнем «Мус-».