Фамилия Муссонов — редкий случай, где основа не очевидна, а суффикс говорит сам за себя. Конечное -ов указывает на классическую русскую патронимическую модель: «чей?» — «Муссонов», то есть сын или потомок человека по прозвищу Муссон. Но что это за прозвище?

Здесь возможны два пути, и оба ведут к географическому или природному явлению. Первый: прямое заимствование слова «муссон» — устойчивого ветра, меняющего направление по сезонам, известного в русском языке с XVIII века. Вряд ли крестьянину в Центральной России дали бы такое прозвище за погоду. Скорее, это могло возникнуть в среде моряков, купцов или людей, связанных с южными портами (Астрахань, Одесса, Баку). Прозвище Муссон могли дать человеку с переменчивым нравом, порывистому, или тому, кто много плавал «по ветрам».

Второй, более вероятный вариант — искажение при записи. Фамилия могла произойти от тюркского или кавказского имени или прозвища, звучащего как «Мусо», «Муса» (арабское имя Моисей, популярное у мусульманских народов). В русских документах приставка -он- могла появиться как адаптация: «Мус(с)он» — от «Муса» с суффиксом -он (как в фамилиях Миронов, Самсонов). Или от слова «мусульманин» в просторечии — «муссон» как сокращение.

Модель образования проста: основа (Муссон) + патронимический суффикс -ов. Это значит, что первый носитель фамилии (предок) носил прозвище или бытовое имя Муссон. Фамилия редкая, в больших справочниках (Унбегаун, Никонов) не фигурирует, что говорит о её локальном бытовании — возможно, на юге России, в казачьих областях или в Поволжье, где смешивались русские и тюркские элементы. Сословно могла принадлежать как крестьянам (если основа — прозвище), так и мещанам или купцам (если связана с морским делом).