Фамилия Мустафиева хранит память о предке, которого звали Мустафий. Это имя — вариант более известного арабского имени Мустафа, что означает «избранный», «самый чистый», «превосходящий других». Потомки человека с таким именем со временем закрепили за собой фамилию Мустафиевы.

Фамилия построена по классической русской модели: к восточному имени добавили русский суффикс принадлежности -ев, который указывает на родство. Форма Мустафиева — женский вариант фамилии, а мужской звучит как Мустафиев. Такое словообразование типично для фамилий, которые возникли в среде, где русская культура взаимодействовала с тюркской и арабской традицией именования.

Само имя Мустафа — одно из почетных в исламской традиции, его нередко давали в честь пророка Мухаммеда, которого называли аль-Мустафа. От этого же корня образованы и другие фамилии: Мустафин, Мустафин, Мустафаев. Они встречаются у татар, башкир, казахов и других народов, исторически исповедующих ислам, но пишутся и произносятся по-разному в зависимости от местных языковых норм.

В русской ономастике фамилии на -ев, образованные от мусульманских имен, фиксировались с XVI–XVII веков, когда служилые татары и другие выходцы с Востока переходили на русскую службу и получали земельные наделы. Их потомки постепенно обрусевали, но сохраняли в фамилии память о родовом имени основателя. Так и род Мустафиевых может проследить свою историю через эту простую, но значимую связку: имя, данное при рождении, стало семейным знаком на многие поколения вперед.