Фамилия Мустаифна — редкий случай, когда на слух почти невозможно определить, русская она или нет. В ней нет привычных суффиксов -ов, -ин или -ский, а окончание -а скорее напоминает женскую форму фамилии в некоторых неславянских языках. Однако если присмотреться, перед нами типичная русская патронимическая модель, только с необычной основой.

Разбор показывает, что фамилия образована от личного имени Мустаиф или его производной формы. Само имя Мустаиф — арабского происхождения, от корня «истифа» — «избранный», «отборный». В исламской традиции это один из эпитетов, указывающий на избранность или чистоту. В Россию такие имена попадали через татарскую и башкирскую среду, а также через народы Северного Кавказа, где арабские имена были распространены благодаря исламу. Таким образом, носитель фамилии Мустаифна — потомок человека, которого звали Мустаиф, а суффикс -на (в мужском варианте, скорее всего, -ов или -ев, но здесь он заменён на -на по женской линии) указывает на принадлежность: «сын Мустаифа» или «дочь Мустаифа».

Поскольку фамилия нестандартна для русской ономастики, её носители, вероятно, происходят из регионов с сильным татарским или кавказским влиянием — Татарстан, Башкортостан, Дагестан. В русских документах XIX века такие фамилии часто записывали с искажениями, поэтому возможны варианты Мустаевна, Мустайфна или даже Мустафина. Последний вариант особенно интересен: фамилия Мустафина (от имени Мустафа) гораздо более распространена, и Мустаифна могла возникнуть как её диалектный или ошибочный вариант, если переписчик не расслышал мягкого окончания.

Сословная принадлежность предков остаётся загадкой: имя Мустаиф не было княжеским или дворянским, но и не обязательно указывало на крестьянство. Скорее всего, это были люди из среды служилых татар, купцов или духовенства, где арабские имена ценились. Сегодня фамилия встречается настолько редко, что её можно считать почти уникальной — это не просто фамилия, а маркер сложного этнического и культурного пути семьи.