Фамилия Мустеца — редкий случай, когда географическое происхождение почти наверняка перевешивает этимологическое. Скорее всего, это молдавская или румынская фамилия, и её основа — слово «musteață» (мустя́цэ), то есть «усы». В румынском языке так могли прозвать человека с заметными, возможно, пышными усами. Суффикс -еца (-eață) здесь не уменьшительно-ласкательный, а образующий существительное от глагольной или предметной основы, так что прозвище было прямым: «Усач». Если фамилия действительно румынского корня, то её носители — выходцы из исторической Молдовы или Валахии, и в русском написании она закрепилась через молдавскую диаспору или переселения XVIII–XIX веков.

Однако есть и второй, менее очевидный путь. Форма «Мустеца» встречается и в некоторых славянских говорах, где могла возникнуть от диалектного глагола «мустить» — мутить, мешать, или от существительного «муст» (сусло, молодое вино). В таком случае прозвище могло относиться к виноделу или человеку, который «мутит воду» — то есть скандалисту. Но эта версия слабее: слово «муст» в славянских языках чаще даёт фамилии типа Мустов, а не Мустеца, и суффикс -еца для славянских прозвищ нетипичен — он характерен для румынского ареала.

Что касается модели, фамилия не имеет привычного русского суффикса принадлежности (-ов, -ин, -ский). Это чистая основа без оформления, что тоже указывает на нерусское происхождение: в румынской ономастике фамилии часто совпадают с нарицательным словом. В русских документах такая фамилия могла писаться через «а» на конце — Мустеца, хотя в оригинале ударение, скорее всего, падает на последний слог: Мустецá.

Известных носителей фамилии в открытых источниках нет, и это не случайно: фамилия крайне редкая, за пределами Молдовы и прилегающих областей Украины (Одесская, Черновицкая) почти не встречается. Для поиска корней стоит начинать с метрических книг Бессарабской губернии или карт расселения молдаван в XIX веке.