Фамилия Мустопаева напрямую связана с личным именем Мустопа. Это не самостоятельное имя, а фонетический, то есть произносительный, вариант более распространённого имени Мустапа. В свою очередь, Мустапа — это чечено-ингушская форма знаменитого арабского имени Мустафа, которое носил пророк ислама.

Смысл имени глубокий и почётный. В переводе с арабского «мустафа» означает «избранный», «самый чистый», «превосходящий других». В исламской традиции это слово — один из эпитетов пророка Мухаммеда, проповедника единобожия и центральной фигуры религии. Поэтому имя, лёгшее в основу фамилии, изначально несло высокий смысловой статус: так называли ребёнка с надеждой на его особые душевные качества.

Модель образования фамилии проста и типична для русской ономастики: к основе Мустопа добавили суффикс принадлежности -ев, который указывает на родство. Форма Мустопаева означает «дочь (или жена) Мустопы». У мужчин эта же фамилия звучит как Мустопáев, и ударение в ней, скорее всего, падает на последний слог основы, хотя в бытовой речи возможны варианты.

Интересно, что фамилия сохранила именно разговорную, «упрощённую» форму имени. Это говорит о том, что предки носителей фамилии в быту использовали не книжный вариант Мустафа, а его адаптированный местный аналог — Мустопа. Такая особенность — типичный пример того, как живая речь закрепляется в официальном родовом имени.

Сам процесс формирования фамилий у народов Кавказа и в среде русского населения шёл постепенно и занял не одно столетие. Поэтому точно определить время и место зарождения конкретного рода Мустопаевых без серьёзных генеалогических изысканий, архивных документов и метрических книг невозможно. Можно лишь уверенно утверждать, что фамилия имеет мусульманские корни и, вероятнее всего, связана с чечено-ингушской или близкой к ней кавказской средой, где имя Мустапа было привычным.